تشخیص باکتری های اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا با استفاده از آنالیز ژن ۲۳s rdna

مقدمه: ژن های dna ریبوزومی با داشتن ویژگی های منحصر به فرد همچون حضور در تمامی سلول های میکروارگانیسم ها، وجود مقادیر بالایی از این ژن ها در سلول و همچنین وجود نواحی محافظت شده یک کاندیدای مناسب جهت شناسایی طیف بالایی از میکروارگانیسم ها می باشند. هدف از این مطالعه، بررسی توالی محافظت شده و اختصاصی ژن 23s rdna به عنوان یک هدف dna در افتراق و غربالگری باکتری های اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا بود. روش ها: سویه های باکتریایی اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا از کلکسیون کشت میکروبی انستیتو پاستور ایران تهیه گردید. استخراج dna از سویه های مورد نظر با استفاده از روش جوشاندن صورت گرفت. پس از بررسی منابع و اطلاعات موجود در بانک ژنی، ترادفی از نواحی محافظت شده ی ژن 23s rdna و نواحی اختصاصی درون ژنی آن با توجه به هم ردیفی توالی ها، در نرم افزار alignx از مجموعه ی نرم افزار vector nti انتخاب شد و pcr (polymerase chain reaction) انجام گردید. یافته ها: نتایج حاصل از هم ردیفی قطعه ی اختصاصی ژن 23s rdna در هر یک از باکتری های مورد بررسی بیانگر وجود قطعه ی ژنی به اندازه ی حدود 880 جفت باز در تمامی باکتری های مورد مطالعه بود. پروب های اختصاصی طراحی شده در هر یک از باکتری های اشریشیا کلی، سالمونلا انتریکا و شیگلا دیسانتری وجود باندهای 226، 444 و 776 جفت بازی را نشان داد. نتیجه گیری: نتایج به دست آمده در این مطالعه نشان داد که توالی 23s rdna انتخاب شده در این پژوهش با توجه به محصولات به دست آمده ی حاصل از تکثیر آن، ناحیه ای مناسب و کارامد جهت افتراق و غربالگری سویه های باکتریایی اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا می باشد.